Paraffin embedding은 조직 샘플의 장기 보존을 위한 최선의 옵션입니다. Paraffin section은 일반적으로 microtome을 사용하여 3~5 micron 사이로 절단됩니다.
샘플에 파라핀을 embedding하기 전에, dissection(해부) 직후에 고정액을 사용하여 perfusion(관류) 또는 immersion(침수)를 통해 샘플을 고정시켜야 하며, 이는 일반적으로 4-24시간이 소요됩니다.
너무 오래 고정시킬 경우 항원이 억제될 수 있으므로, 샘플을 24시간 이상 고정하지 않습니다. 고정 시간은 최적화가 필요할 수 있으며, 조직 및 항원에 따라 달라질 수 있습니다.
파라핀은 물과 섞이지 않기 때문에, 파라핀 왁스를 첨가하기 전에 조직 샘플을 건조시켜야 합니다.
샘플을 농도가 첨차 증가되는 알코올에 immersion시켜 탈수할 수 있습니다. 알코올 농도의 점진적인 증가는 세포 손상을 최소화합니다.
알코올에서 탈수가 완료되면, 샘플을 xylene에 넣어 남은 에탄올을 제거합니다.
파라핀은 embedding을 위해 60°C로 가열되고, 밤새 굳혀집니다. 이어서, 조직은 microtome을 사용하여 얇은 section으로 절단될 수 있습니다.
이러한 조직 section은 rehydration 및 IHC 프로토콜이 시작될 때까지 상온에 보관할 수 있습니다.
*일부 항원(예: post-translationally modifed residue이 있는 항원)은 가벼운 알데히드 고정에도 보존될 수 없습니다.
이러한 경우, 조직을 급속동결시켜 cryostat(저온유지장치)에서 section해야 하며, 알코올이나 차가운 아세톤으로 고정될 때까지 -80°C에서 보관되어야 합니다.