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[Beckman] Flow Cytometry Software

드림셀인스 2023-10-19 조회수 868

Beckman - Flow Cytometry Software


CytoFLEX Flow Cytometer

CytoFLEX 플랫폼은 혁신적인 기술을 활용할 수 있는 벡크만쿨터의 유세포 분석기(flow cytometer) 플랫폼입니다. CytoFLEX 유세포 분석기는 사용하기 쉬운 시스템에서 필요한 성능을 제공하므로 계측이 아닌 연구에 집중할 수 있습니다. 모든 구성에서 탁월한 감도와 해상력으로 다른 유세포 분석 시스템보다 4 배나 큰 크기를 제공합니다. 플랫폼의 모든 기기는 CytoFLEX Acquisition and Analysis Software을 위해 CytoExpert를 사용 합니다. 

CytExpert Software for the CytoFLEX Platform



CytExpert는 장비의 구동, 데이터 수집 및 분석을 제어하는 탁월한 소프트웨어 프로그램입니다. 초보 작업자부터 숙련된 유세포 분석 전문가까지 모든 작업자가 시스템을 신속하게 작동하고 실험 기반 프로토콜을 설정하며 발표 가능한 데이터 품질을 확보할 수 있습니다.


  • 사용자 로그인이 필요 없는 기본 설치 옵션
  • 사용자 및 역할 관리 기능이 포함된 사용자 관리 설치 옵션
  • 전자 레코드 관리 설치 옵션은 21 CFR Part 11 준수를 위한 도구 제공

수집 기능




  1.  수집 설정: 수집 설정 탭에서 원하는 수집 설정을 선택합니다. FCS 파일 또는 설정 카탈로그에서 설정을 가져올 수 있습니다. 
  2.  채널: 채널을 선택하고 채널 탭에서 레이블 이름을 생성합니다.
  3.  보정 매트릭스: 보정 매트릭스 탭에서 보정을 설정합니다.
  4.  중지 규칙: 중지 규칙 탭에서 기록할 이벤트, 기록할 시간 또는 기록할 볼륨을 선택합니다.
  5.  맞춤형 메타 데이터: 최대 10 개의 샘플 식별자를 수동 입력합니다. 또는 .csv 파일에서 플레이트 레이아웃으로 가져옵니다.


분석 기능

플롯 유형게이트통계보정
  • Histograms
  • Dot plots
  • Density Plots
  • Contour Plots
  • Overlay Plots
  • Pseudo Color Plots
  • Heat Map
  • Lasso
  • Polygon
  • Rectangle
  • Four-quadrant
  • Hinged
  • Auto polygon
  • Number
  • % Total 
  • % Gated 
  • % Grandparent 
  • Median
  • Arithmetic Mean
  • Mode
  • Standard Deviation (SD)
  • Coefficient of Variation (CV)
  • Absolute Count 
  • Adjusting Compensation
  • Saving a Compensation File
  • Saving a Compensation Library
  • Importing a Compensation file
  • Accounting for Autofluorescence

 


컴퓨터 최소 요구 사항

필요 프로세서4세대 Intel® Core™ i3(3MB Cache, 2.90GHz) 이상
필요 운영 체제Windows 7, 8, 10 Professional, 64비트
필요 메모리4GB RAM 이상
필요 하드 디스크 공간분석용 실험 디스크를 위한 최소 1G의 여유 공간 데이터 수집을 위해 10G 권장
필요 디스플레이최적의 디스플레이를 위한 1920x1080 해상도
USB 포트데이터 수집을 위해 USB 2.0 이상



Use the Kaluza Cytobank Plugin to Upload Processed Files to the Cloud for Further Analysis





Steps in the Flow Cytometry Analysis Pipeline covered by Kaluza and the Cytobank platform. The Cytobank platform offers automatic compensation calculation but manual adjustment of the compensation matrix is easier to perform in Kaluza. Gating steps on biaxial plots work well in both systems. For exploratory data analysis, clustering and data visualization Cytobank is the software of choice.


Kaluza Analysis Software






Kaluza의 기능

The Kaluza Philosophy


Context specific radial menus put functions at your fingertips

Four control panels access all aspects your data

Real time adjustments to data display


Upgrade to Version 2.1


Added 19 new features and 14 improvements, see Release Notes for complete list.

Analyze Any Flow Cytometry Standard (FCS) Compliant File

Added Auto-gating function, Rare Event and Cell Cycle analysis


The Kaluza Difference


Enhanced color compensation algorithms

Processing capabilities for multidimensional analysis

Built in batch processing for high throughput labs

Full featured suite of analysis tools


Administrator Tools


Install the Network License Control Center on a shared server to manage 10 to over 1000 users

Create detailed usage reports and query logs for specific users

View current license keys and use to activate new keys



Cytobank Premium





Cytobank의 기능

Reduce Subjectivity

Automatically cluster phenotypically similar cells using FlowSOM or SPADE
Use dimensionality reduction suite algorithms to visualize multidimensional data in a two-dimension plot, facilitating identification of rare biological subsets
Automatically identify predictive biomarkers with statistical power among groups using CITRUS
Reduce variability and save time by automating your gating strategy

Data to Insight
ML-assisted algorithms help discover unexpected phenotypes and create visualizations to present results
Leverage the compute power of the cloud to run algorithms in parallel, speeding up settings optimization
Add our data scientists to your team to provide bioinformatics expertise for complex projects

Collaborate

Cloud-based data archiving and storage, ideal for users who need traceability of analysis results and settings
Easy user-defined, secure sharing of annotated data and protocols with anyone with a web-enabled device
Collaborators can work in real-time on the same datasets; changes to experiments are saved instantly on a centralized server

Democratize ML-assisted Analysis

Made for biologists, no coding or plugins required, visit the Learning Center
Online knowledge repository full of articles, tips and tricks and support request form for new questions
Use the Experiment Manager to organize and find your projects, use the tree view to show relationships between experiments


Cytobank Premium Specifications

CompatibilityFCS 2.0, 3.0, and 3.1 files from instrument agnostic. DROP is able to import any numeric data in a text delimited (comma, semicolon, tab) format.
Plot TypesContour Plots, Density Plots, Dot Plots, Heatmap, Histograms, Overlay Plots
AlgorithmsCITRUS, FlowSOM, SPADE, viSNE, UMAP, opt-SNE, tSNE-CUDA, Automatic Gating, PeacoQC
Statistics
  • Student’s t-test
  • Mann-Whitney U test
  • Paired student’s t-test
  • Wilcoxon signed-rank test
  • Kruskal-Wallis H test
  • One-way analysis of variance
  • Two-way analysis of variance
    License TypeAcademic, Commercial
    License Term1–3 Years


    21 CFR Part 11 준수를 위한 CytExpert

    FDA에 보고되는 품질 관련 의사결정 또는 데이터 생성에 사용되는 데이터를 저장하는 모든 컴퓨터 시스템은 21 CFR Part 11을 준수해야 합니다. 이 법률의 목적은 전자 기록과 전자 서명을 신뢰 가능하고 종이 기록과 동등한 것으로 간주하기 위한 기준을 정의하는 것입니다.


    CytoFLEX 유세포 분석기 플랫폼에 사용할 수 있는 CytExpert v2.3 전자 기록 관리 시스템은 21 CFR Part 11을 쉽게 준수하도록 설계되었습니다. CytExpert v2.3은 암호를 통해 보호되는 소프트웨어로 장비의 작동을 관리하고 검사 합계 및 감사 추적을 사용하여 데이터 무결성 제어를 보호하며, 서명, 서명 체계 및 보관 기능을 통해 문서를 관리합니다.















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