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유전자 발현 분석은 세포의 기능과 상태를 이해하는 데 중요한 정보를 제공합니다. 3D cell culture 모델은 2D 모델에 비해 더 실제와 가까운 환경을 모방하기 때문에 유전자 발현 및 genome 분석에서 보다 정확하고 의미 있는 결과를 얻을 수 있습니다. 이러한 분석은 질병 메커니즘 이해, 신약 개발, 맞춤 의학에 큰 도움이 됩니다. 프로메가의 3D assay 포트폴리오는 유전자 발현 및 분석에서 정밀하고 신뢰할 수 있는 데이터를 제공하는 토탈 솔루션을 제공합니다.

이번 글에서는 유전자 발현 및 genome 분석을 위한 프로메가의 assay에 대해 소개합니다.

추출부터 분석까지 최상의 ‘유전자 발현’ 결과를 위한 RNA workflow

성공적인 RNA 추출은 downstream application에서 신뢰할 수 있는 결과를 제공하기 때문에 유전자 분석에 있어 가장 중요한 단계입니다. 프로메가는 3D 모델에 대해 매뉴얼 및 자동화 방법 모두에서 고효율, 고품질의 RNA를 추출할 수 있는 시약과 장비를 제공합니다. 또한 cDNA 합성에서 Real-Time qPCR 분석까지 RNA workflow 전체에 필요한 시약을 제공하여 더 정확한 결과를 얻을 수 있도록 지원합니다.

     º RNA (자동화 장비, 매뉴얼)

     º Downstream RNA 분석

       - RNase protection

       - cDNA 합성

       - Real-Time qPCR

 ⊙주요 제품: Maxwell® RSC simplyRNA Tissue kit

 ⊙주요 특징

     º 고품질 RNA 추출 가능

     º 자동화된 추출 플랫폼

     º 간소화된 프로세스 및 모든 소모품이 포함된 키트

HEK293 microtissue에서 자동화 핵산 추출 장비를 이용한 RNA 추출 결과

(A) Maxwell® RSC 48 자동화 핵산 추출 장비는 최대 48개의 샘플에서 동시에 핵산 추출할 수 있습니다. (B) Maxwell® 추출 키트 구성. Maxwell® 키트는 3~7 단계의 washing 과정을 거쳐 순도 높은 RNA를 추출합니다. (C) 4일간 배양한 HEK293 microtissue에서 프로메가의 RealTime-Glo™ MT Cell Viability Assay를 진행한 샘플에서 추출한 RNA 농도 및 RIN 값입니다. Kinetic viability assay 진행 여부와 상관없이 동일한 샘플에서 고순도, 고효율의 RNA가 추출되었습니다.

질병의 유전적 연관성을 밝혀내기 위한 첫 걸음 ‘Genome 분석’

많은 연구자들이 3D culture model을 사용하는 주요 이유 중 하나는 질병의 특징을 잘 반영하는 모델을 통해 질병 메커니즘을 연구하고 임상과 유사한 신약 효능 평가 결과를 얻기 위해서입니다. 이러한 접근 방법과 함께 질병의 유전적 원인을 이해하면 유전자형과 표현형 사이의 관계를 명확히 할 수 있으며, 이는 세포의 특정 행동(cell fate)을 이해하는 데 도움이 됩니다. 이 과정에서 연구자가 구축한 질병 모델이 원하는 세포의 특성을 정확히 반영하는지 확인하기 위해 STR 분석이 필수적입니다.

프로메가는 이러한 genome 분석의 시작점인 genomic DNA 추출부터 Sanger sequencing에 필요한 시약 및 장비, 그리고 STR 분석을 위한 경쟁력 있는 시약을 제공합니다. 

     º  Genomic DNA 추출

     º Genome 분석 (sequencing)

     º STR 프로파일링

 ⊙주요 제품: GenePrint® 10 & 24 System / Spectrum Compact CE System

​ ⊙주요 특징

     º 고유한 allele 식별로 높은 판별력 제공

     º 빠른 cycling과 더 많은 loci를 통해 간소화된 workflow

     º 작은 키트 크기와 적은 반응 부피로 경제적이고 효율적인 시스템

프로메가의 3D assay 포트폴리오는 복잡한 3D cell culture 모델에서 유전자 발현 변화,

genome 분석을 통해 정확한 결과를 얻을 수 있도록 지원합니다. 각 assay에 대한 세부 정보와 응용 방법에 대해

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[출처] [3D Assay] 세번째 이야기: 검증된 프로메가 3D assay 포트폴리오_Gene expression change/Genome analysis|작성자 Promega Korea